Detail Perlakuan pemanasan awal sampel DNA genom dan keberhasilan deteksi molekuler Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4 (Foc4) menggunakan PCR (article of Pertemuan Ilmiah Nasional dan Kongres Mikoina Bandung, 28-30 Mei 2015) Bibliografi Author: Karmawan, Listya Utami ; Aryantha, I Nyoman Pugeg ; Dwivany, Fenny Martha Topik: kultur murni Foc4; isolasi genom; deteksi molekuler; perlakuan pemanasan awal; PCR; JABFUNG-FTB-LUK-2022 Bahasa: (ID )     Penerbit: Perhimpunan Mikologi Indonesia     Tempat Terbit: Bandung    Tahun Terbit: 2015     Jenis: Poster Fulltext: Genap 2014_NasSeminar_Mikoina.pdf (5.15MB; 4 download) Abstract Penyakit tanaman terutama yang menyerang tanaman pertanian dan perkebunan dapat mengancam ketahanan pangan. Salah satu penyakit tanaman yang penyerang tanaman pisang adalah layu fusarium. Penyakit ini disebabkan oleh Fusarium oxysporum f.sp. cubense tropical race 4 (Foc4). Penyakit layu fusarium telah menyebar Indonesia dan berbagai isolat Foc4 telah berhasil diisolasi dari berbagai lokasi di Indonesia. Deteksi secara molekuler yang bersifat spesifik dan dapat diandalkan dibutuhkan untuk mendeteksi infeksi Foc4 secara cepat dan akurat. Walaupun protokol deteksi molekuler untuk isolat Foc4 menggunakan metode PCR telah ada, untuk beberapa kasus dibutuhkan modifikasi metode. Sampel genom Fusarium yang sulit diamplifikasi perlu diberi perlakuan awal pemanasan pada 65°C selama l0 menit diikuti dengan inkubasi pada es selama 5 menit sebelum diracik ke dalam pereaksi Polymerase Chain Reaction (PCR). Pemanasan ini dapat membantu denaturasi DNA genom sehingga pelekatan primer dan reaksi PCR dapat berjalan dengan lebih baik. Selain itu, metode isolasi genom fungi yang dikembangkan oleh Moller et al. 1992 dapat dipersingkat dengan meniadakan tahapan inkubasi di dalam es selama 30 menit dan sentrifugasi selama 10 menit setelah perlakuan pengendapan DNA oleh NH4-asetat. Konsentrasi DNA genom Foc4 yang diperoleh berkisar antara 10-90 ng/mikro-l dengan kemurnian (OD 260/280) berkisar di antara l.875-2.333. Identifikasi molekuler terhadap Foc4 menggunakan primer FocTR4-F/R, EF-l/2, dan ITS5/4 masing-masing menghasilkan pita DNA yang berukuran 428 pb, 657 pb, dan 483 pb. Analisis hasil sekuensing menunjukkan sampel yang diuji adalah benar Foc4. Opini Anda Klik untuk menuliskan opini Anda tentang koleksi ini! Lihat Sejarah Pengadaan  Konversi Metadata   Kembali

Copyright © 2006, 2007 Unika Atma Jaya, all rights reserved