Detail Identifikasi In Silico dan Kompilasi Sekuen Homolog Right Border T-DNA dalam Genom Tanaman Bibliografi Author: WAHYUNANTO, IRANG ; Sentausa, Erwin (Advisor); Wijaya, Grace Yasmein (Advisor) Topik: In-Silico data Mining; Right Border; BLAST; Database Bahasa: (ID )     Penerbit: Fakultas Teknobiologi Unika Atma Jaya (Faculty of Biotechnology Atma Jaya Catholic University of Indonesia)     Tempat Terbit: Jakarta    Tahun Terbit: 2008     Jenis: Theses - Undergraduate Thesis Fulltext: Irang Wahyunanto's Undergraduate Theses.pdf (928.36KB; 9 download) Ketersediaan Perpustakaan Pusat (Semanggi) Nomor Panggil: FTB-154 Non-tandon: tidak ada Tandon: 1  Lihat Detail Induk Abstract Pembuatan P-DNA membutuhkan sekuen genom tanaman yang homolog dengan sekuen right border Agrobacterium. Pada penelitian ini, dilakukan identifikasi sekuen homolog right border T-DNA pada genom tanaman dan pembuatan sistem basis data yang memuat informasi tentang sekuen right border Agrobacterium dan sekuen homolognya pada genom tanaman. Sekuen right border dikumpulkan secara in silico pada basis data genom NCBI. Terdapat 477 sekuen right border yang terpilih. Sekuen-sekuen tersebut dianalisis dengan menggunakan program bioinformatika seperti BioEdit dan ClustalW, kemudian dikategorisasikan menjadi 24 kelompok sekuen right border. BLASTN digunakan untuk menyejajarkan ke-24 sekuen right border dalam basis data genom tanaman. Parameter untuk penalti mismatch adalah -1 dan untuk E-value sebesar 105. Sekuen right border dari tanaman yang memiliki E-value kurang dari 10 dikompilasikan dengan data sekuen right border Agrobacterium untuk membuat suatu sistem basis data. Sekuen homolog right border yang didapatkan dari proses penyejajaran berjumlah 397 sekuen. Opini Anda Klik untuk menuliskan opini Anda tentang koleksi ini! Lihat Sejarah Pengadaan  Konversi Metadata   Kembali

Copyright © 2006, 2007 Unika Atma Jaya, all rights reserved