Peningkatan kualitas dan kuantitas serta perluasan peran tanaman
pertanian di masa mendatang penting dilakukan dan akan sangat didukung oleh
penemuan-penemua n gen potensial yang memiliki nilai ilmiah dan/atau ekonomi
yang tinggi (Gene discovery). Gen sebagai unit fungsional sekuen DNA dapat
diisolasi, diklonkan dan diekspresikan di organisme lain termasuk tanaman
pertanian. Oleh karena itu teknik rekayasa ini berpeluang besar di masa depan
untuk meningkatkan mutu dan peran tanaman (plant genetic improvement). Dari
sekian banyak varietas tanaman transgenik yang dikembangkan di Indonesia,
hampir semua gen yang diintroduksikan berasal dari paten negara lain. Fenomena
ini menarik perhatian untuk mengeksplorasi kekayaan genetik yang dimiliki
Indonesia sebagai sumber gen-gen potensial. Gene discovery dapat dikatakan
sebagai paradigma yang penting ditelaah, dipahami dan dilakukan/didukung oleh
semua pihak (terutama pemerintah, pengusaha dan ilmuwan) untuk
memberdayakan kekayaan genetik yang telah tersedia. Gene Discovery dapat
dilakukan melalui kegiatan isolasi dan karakterisasi gen-gen dari organisme yang
memiliki “kelebihan” dan menarik perhatian. Eksplorasi genetik penting
dilakukan pada organisme -organisme yang viabel pada kondisi kritis.Terdapat dua
strategi utama identifikasi dan isolasi gen dari berbagai organisme. Pertama
adalah reverse genetics yaitu mempelajari fenotipe terkait dengan knockdown gen,
teknik ini dilakukan dengan represi transkrip oleh antisense atau sense RNA,
mutasi, insersional mutagenesis dan gen trapping. Kedua adalah inverse genetics
yaitu mempelajari pola ekspresi (fenotipe) pada kondisi spesifik dan mencari gengen
spesifik yang bertanggung jawab pada kondisi tersebut, teknik ini dilakukan
dengan penapisan differensial berdasarkan pustaka cDNA, protein, dan fenotipfenotip
parsial yang bisa dibedakan secara nominal. Dari kedua startegi tersebut
telah dan akan dihasilkan gen-gen yang dapat digunakan untuk mengisolasi gen
sejenis dari organisme lain terutama yang sekerabat pada pustaka genom atau
pustaka cDNA, mengembangkan mikroerrai dan DNA chip. Dengan diisolasinya
gen-gen yang memiliki nilai keilmuan dan ekonomi yang tinggi, akan sangat
mendukung bioteknologi pertanian dengan terciptanya tanaman berproduktivitas
tinggi dan perluasan fungsi pertanian melalui plant biofarming |