Gene S Characterization of Hantavirus Species Seoul Virus Isolated from Rattus Norvegicuson an Indonesian Island  

Oleh:

Perwitasari, Dian ; Ibrahim, Ima Nurisa ; Yasmon, Andi

Jenis: Article from Journal - ilmiah nasional
Dalam koleksi: Health Science Journal of Indonesia vol. 05 no. 01 (Jun. 2014), page 1-6.
Topik: Seoul Virus; Gen S; Kepulauan Seribu; Indonesia
Fulltext: Vol 5 No 1 June 2014 p. 1-6.PDF (183.58KB)

Ketersediaan

Perpustakaan PKPM Nomor Panggil: H25 Non-tandon: 1 (dapat dipinjam: 0) Tandon: tidak ada	Lihat Detail Induk
Perpustakaan FK Nomor Panggil: H25.K Non-tandon: 1 (dapat dipinjam: 0) Tandon: tidak ada	Lihat Detail Induk

Isi artikel

Latar belakang: Hantavirus hidup dan berkembang biak di tubuh hewan pengerat, salah satunya Rattus norvegicus yang banyak ditemukan di daerah kepulauan di Indonesia. Hantavirus spesies Seoul virus (SEOV) adalah virus RNA negatif rantai tunggal yang termasuk dalam keluarga Bunyaviridae, mempunyai beberapa gen spesifik terutama gen S yang dapat dikembangkan untuk uji diagnostik. Tujuan penelitian ini ialah untuk mengetahui karakter dari gen S dari Hantavirus spesies Seoulvirus. Metode:Pada penelitian ini dilakukan sekuensing gen S yang berasal dari jaringan paru-paru rodensia. Fragmen DNA yang disekuensing menggunakan primer DNA SEOS-28F danSEOS -360R,VNS-1501F dan VNS-CSR. Hasil sekuensing dianalisis menggunakan program seqscapedan dianalisis menggunakan program Bioedit dan Mega5. Analisis filogenetik untuk homologi nukleotida dan asam amino dari ketiga strain Kepulauan Seribu tersebut dibandingkan dengan spesies hantavirus lainnya yang diambil dari genebank. Hasil:Analisis Homologi nukleotida dan asam amino antara strain Kepulauan Seribu dengan SEOV menunjukkan homologi nukleotida tertinggi pada strain KS74 (88,4%) dan terendah pada KS90 (87,2%), sedangkan homologi asam amino tertinggi adalah strain KS74 (91.3%) dan terendah pada strain KS90 (89,5%). Kesimpulan:Karakter gen S virus yang ditemukan di Kepulauan Seribu sebanding dengan virus SEOV yang ditemukan di Singapura dan Korea.

Opini Anda

Klik untuk menuliskan opini Anda tentang koleksi ini!

Kembali