Multilocus Sequence Analysis of Cercospora spp. from Different Host Plant Families  

Oleh:

Yuliarni, Floreta. F ; Sjamsuridzal, Wellyzar ; Hidayat, Iman

Jenis: Article from Journal - ilmiah nasional - terakreditasi DIKTI
Dalam koleksi: Makara Seri Sains vol. 17 no. 02 (Aug. 2013), page 47-57.
Topik: Cercospora ; host specificity ; leaf spot; multilocus sequence ; phylogenetic analysis
Fulltext: 2098-3927-1-SM_Paskl.pdf (113.77KB)

Isi artikel

Analisis Sequence Multilokus Cercospora spp. dari Beberapa Famili Tanaman Inang yang Berbeda . Identifikasi genus Cercospora masih menjadi perdebatan karena preferensi tanaman inang sering digunakan sebagai kriteria utama untuk mengusulkan spesies baru. Penelitian bertujuan menguji host specificity Cercospora spp. dengan tanaman inangnya. Pengujian dilakukan dengan melihat hubungan kekerabatan antara tanaman inang dan variasi sequence multilokus (daerah ITS rDNA, gen elongation factor 1-a (EF), dan gen calmodulin (CAL) pada Cercospora spp. Analisis filogenetik menggunakan 53 strain Cercospora spp. yang menginfeksi 12 famili tanaman inang. Sequence dari 23 strain Cercospora spp. pada penelitian menginfeksi famili tanaman Asteraceae , Cucurbitaceae , dan Solanaceae, dan sequence dari 30 strain Cercospora spp. berasal dari GenBank menginfeksi famili tanaman Fabaceae , Amaranthaceae , Apiaceae , Plumbaginaceae , Malvaceae , Cistaceae , Plantaginaceae , Lamiaceae , dan Poaceae . Analisis filogenetik menunjukkan bahwa mayoritas spesies Cercospora tidak host specific , hanya C. zinniicola , C. zeina , C. zeae -maydis, C. cocciniae , dan C. mikaniicola yang menunjukkan host specificity . Spesies-spesies Cercospora yang memiliki hubungan kekerabatan sangat dekat, tidak dapat dipisahkan menggunakan analisis filogenetik secara molekuler berdasarkan daerah ITS rDNA, gen EF, dan gen CAL. Gen CAL menunjukkan topologi pohon yang lebih baik dibandingkan daerah ITS rDNA dan gen EF. Topologi pohon filogenetik gen CAL tersebut dapat memisahkan spesies-spesies Cercospora lebih baik dibandingkan dengan dua lokus yang lain.

Opini Anda

Klik untuk menuliskan opini Anda tentang koleksi ini!

Kembali