Genus Diversity of Actinomycetes in Cibinong Science Center, West Java, Indonesia  

Oleh:

Widyastuti, Yantyati ; Lisdiyanti, Puspita ; Ratnakomala, Shanti ; Kartina, Gina

Jenis: Article from Journal - ilmiah nasional - terakreditasi DIKTI
Dalam koleksi: Microbiology Indonesia vol. 06 no. 04 (Jun. 2012), page 165-172.
Topik: actinomycetes; Indonesia; keragaman; sekuensing gen 16S rRNA
Fulltext: 4 193-657-8-PB_Paskl.pdf (2.14MB)

Isi artikel

Actinomycetes merupakan mikroorganisma tanah yang mempunyai peran pada bidang kesehatan. Oleh karena itu, upaya pencarian species actinomycetes baru banyak dilakukan. Tujuan penelitian ini adalah melihat keanekargaman actinomycetes tingkat genus di Cibinong Science Center (CSC), Jawa Barat. Sampel untuk isolasi actinomycetes adalah tanah dan serasah. Metode isolasi yang digunakan adalah dry heat (DH), sodium dodesil sulfat-yeast extract (SDS-YE), rehydration and centrifugation (RC), dan oil separation (OS). Sebanyak 263 isolat actinomycetes telah diperoleh dari CSC pada tahun 2004-2006. Dari jumlah tersebut 58 dari metode DH, 144 isolat dari SDS-YE, 50 dari RC dan 11 dari OS isolat. Identifikasi isolat dilakukan menggunakan metoda sekuen gen 16S rRNA. Hasilnya menunjukkan adanya famili Kineosporiaceae, Micromonosporaceae, Nocardiaceae, Pseudonocardiaceae, Streptomycetaceae, Streptosporangiaceae, Mycobacteriaceae, Nocardioidaceae, Nocardiopsaceae, dan Thermomonosporaceae. Dari famili tersebut diperoleh 23 genus. Nilai kesesuaian isolat berdasarkan analisis BLAST menggunakan sekuen 16S gen rRNA sebagai queri dibandingkan dengan species yang terdaftar pada data base menunjukkan bahwa 131, 91, 30, dan 6 isolat masing-masing mempunyai kesamaan sebesar =99, 98, 97, dan =96%. Enam isolat dengan kesesuaian =96% sangat menarik untuk diungkap sebagai taxa baru. Pada penelitian ini, diperoleh isolat terbanyak dari genus Streptomyces.

Opini Anda

Klik untuk menuliskan opini Anda tentang koleksi ini!

Kembali