Famili Anatidae beranggotakan berbagai spesies itik dan angsa (duck, goose and swan) yang
tersebar luas di seluruh dunia (kosmopolit) dengan ragam spesies yang cukup besar. Keragaman ini
merupakan sumber daya genetik yang sangat penting sebagai upaya konservasi. Sekuens
cytochrome-b sering dipakai sebagai analisis keragaman genetik ini. Data sekuens dari 39 spesies
yang termasuk famili Anatidae dan satu species (Gallus domesticus) sebagai outgroup dipakai untuk
analisis keragaman sekuens dengan menggunakan MEGA2.1 Software. Analisis sekuens
menunjukkan bahwa dari seluruh sekuens yang dibandingkan ditemukan transisi dan transversi
nukleotida. Transisi terjadi pada 27 posisi dengan rincian 2 pada basa ke-1, 2 posisi pada basa ke-2
dan 23 posisi pada basa ke-3, dan transversi terjadi di 10 posisi dengan rincian 2 kali pada basa ke-1,
1 pada basa se-2 dan 6 pada basa ke-3. Rata-rata asam amino dari seluruh sekuens adalah sebagai
berikut: Ala (9.39), Cys (2.94), Asp (1.08), Glu (0.98), Phe (6.80), Gly (8.96), His (3.14), Ile (6.80), Lys
(1.01), Leu (16.49), Met (2.06), Asn (4.74), Pro (0.98), Gln (2.00), Arg (2.98), Ser (5.95), Thr (8.77),
Val (5.23), Trp (1.96), Tyr (7.72). Dari keseluruhan sekuens, keragaman asam amino tampak nyata
pada 20 asam amino terakhir jika dibandingkan dengan outgroup. |